La Asociación de Madres y Padres de Alumnos (A.M.P.A.) es el órgano representativo de las familias dentro de las estructuras del colegio. Es una asociación abierta en la que cualquier padre o madre de alumno del centro está invitado a tomar parte y, si así lo desea, colaborar de forma voluntaria en las distintas actividades que desde la asociación se organizan con el fin de complementar la oferta educativa de la escuela.
La asociación dispone de un pequeño despacho situado en el mismo edificio en el que se encuentran situadas las aulas de los alumnos de dos años y desde el que, normalmente, se atiende a las familias a partir de las 17:00 horas (Teléfono: 943 464359).
Esta asociación consta de una estructura organizada para la consecución de los diferentes fines y actividades para los que ha sido creada. Como órgano representativo, regido por estatutos propios, existe la figura de la Junta la cual consta de Presidente, Vicepresidente, Secretaría, Tesorería y Vocales.
De todas las actividades que desde la AMPA se gestionan, subvencionan u organizan destacaríamos:
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La tradicional Fiesta de Santo Tomás (21 de diciembre) que consiste en una feria-mercado en miniatura que se organiza en el patio de la escuela con animales, puestos de verdura, fruta, charcutería y pastas, venta de bocadillos y bebidas y un puesto dedicado a una O.N.G.
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La Tamborrada Infantil del día 19 de Enero, víspera del día de San Sebastián, donde los alumnos desfilan por las calles del barrio de Amara.
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También, se coordinan, gestionan y organizan las Actividades Extraescolares fundamentalmente deportivas y el Servicio de Guardería que el centro oferta en horario de 8:00 a 9:00 horas.
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La Fiesta y la Excursión de Fin de Curso en las que la totalidad de madres, padres y alumnos, están invitados a participar.
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Apoyo, en forma de subvención, para ciertas actividades complementarias del alumnado (desplazamientos a instalaciones deportivas, excursiones..)

Para el mantenimiento de esta asociación, todas las familias del centro contribuyen con una cuota única anual por unidad familiar independientemente del número de hijos que la compongan. El pago de la citada cuota se realiza por domiciliación bancaria y el importe asciende a 35,00 € por curso escolar.
El logotipo que representa a la A.M.P.A. recrea la figura a caballo de la "Monja Alférez” Catalina de Erauso que da nombre al colegio.